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商品簡介
序
目次
商品簡介
《基因組3》在前兩版的基礎上對原有內容進行了大量的更新和擴充，并對部分章節和內容進行了重排，使背景資料更充實，層次更清晰，行文更流暢。本書共包含四大部分內容，分別為研究基因組、基因組結構、基因組功能和基因組的復制及進化。本書以清新而簡明的寫作風格將基因組學的概念、觀點和內容與傳統的基因分子生物學和分子遺傳學研究方法相結合，為基因組作為生命藍圖所起的作用提供了全新的視角。本書內容翔實，深入淺出，引人入勝，根據內容需要采用大量圖表，形象而簡潔，是一部適合作為教材的基因組學讀物。本書非常適合作為生物、醫學、農學、林學等相關學科本科生和研究生的基因組學課程教材，也可供專業科技人員閱讀。
序
從《基因組2》的出版到現在，四個激動人心的年頭已然過去。
不時有新完成的人類染色體序列被公佈，黑猩猩基因組的測序也已經完成。真核生物中部分或全部序列已明確的物種數目在迅猛增加，而且新的原核序列每週都在實時地更新著。轉錄組和蛋白質組的實驗技術為研究基因組表達提供了新的視點，同時系統生物學這一新學科正在把基因組研究與細胞生物化學聯繫在一起。所有這些進展都已經被加入到這本《基因組3》之中。特別是以前單獨一章的“基因組結構”被分解成了三個章節，而且，通過撰寫如何分析序列及如何研究轉錄組及蛋白質組的獨立章節，本書極大地豐富了後基因組學方面的材料。我也抓住時機，更加深入地描述了基因組的表達、複製和重組。
上述變化已經使《基因組》一書篇幅增加不少，作為補償，我努力令這本書更便於使用。現在，“技術註解”只用於描述技術。這樣，正文作為一個整體就不那麼零散，從而有了更加連續的敘述。插圖已經徹底重新設計，圖表變得更加明了，更加引人人勝。閱讀條目和章節結尾處的習題也已進行了相應全面的再評估。
在做這些修改的過程中，我已經考慮到一些來自世界各地的教師和學生們的反饋。這些人“不勝枚舉”，我只好向大家一起道聲謝謝。有一個我要單獨感謝的人，他就是曼徹斯特大學的Daniela Delneri，他關於後基因組以及分子進化章節的註釋是如此全面，以致我自己幾乎不需要在這些領域再做任何調研了。我還非常感謝紐約州立大學Fredonia校區生物系的TedLee，他承擔了令人畏懼的（至少對我是如此）任務，為書中每一章撰寫綜合問答及習題，這些學習輔助材料極大地提升了本書的價值。我還要感謝Garland Science出版社的Dominic Holdsworth和Jackie Harbor，他們在我準備《基因組3》的過程中給予了巨大的支持。感謝Matthew McClements重新設計了精彩插圖。在第一版中我就寫過“如果這本書對你有幫助，那就請你謝謝Keri，而不是謝謝我，因為是她促成了本書的完成”，我很高興能有這樣的人促使我致力於本書的編寫。
不時有新完成的人類染色體序列被公佈，黑猩猩基因組的測序也已經完成。真核生物中部分或全部序列已明確的物種數目在迅猛增加，而且新的原核序列每週都在實時地更新著。轉錄組和蛋白質組的實驗技術為研究基因組表達提供了新的視點，同時系統生物學這一新學科正在把基因組研究與細胞生物化學聯繫在一起。所有這些進展都已經被加入到這本《基因組3》之中。特別是以前單獨一章的“基因組結構”被分解成了三個章節，而且，通過撰寫如何分析序列及如何研究轉錄組及蛋白質組的獨立章節，本書極大地豐富了後基因組學方面的材料。我也抓住時機，更加深入地描述了基因組的表達、複製和重組。
上述變化已經使《基因組》一書篇幅增加不少，作為補償，我努力令這本書更便於使用。現在，“技術註解”只用於描述技術。這樣，正文作為一個整體就不那麼零散，從而有了更加連續的敘述。插圖已經徹底重新設計，圖表變得更加明了，更加引人人勝。閱讀條目和章節結尾處的習題也已進行了相應全面的再評估。
在做這些修改的過程中，我已經考慮到一些來自世界各地的教師和學生們的反饋。這些人“不勝枚舉”，我只好向大家一起道聲謝謝。有一個我要單獨感謝的人，他就是曼徹斯特大學的Daniela Delneri，他關於後基因組以及分子進化章節的註釋是如此全面，以致我自己幾乎不需要在這些領域再做任何調研了。我還非常感謝紐約州立大學Fredonia校區生物系的TedLee，他承擔了令人畏懼的（至少對我是如此）任務，為書中每一章撰寫綜合問答及習題，這些學習輔助材料極大地提升了本書的價值。我還要感謝Garland Science出版社的Dominic Holdsworth和Jackie Harbor，他們在我準備《基因組3》的過程中給予了巨大的支持。感謝Matthew McClements重新設計了精彩插圖。在第一版中我就寫過“如果這本書對你有幫助，那就請你謝謝Keri，而不是謝謝我，因為是她促成了本書的完成”，我很高興能有這樣的人促使我致力於本書的編寫。
目次
譯者序
第三版前言
第二版前言
第一版前言
內容介紹
縮略語
第1篇 研究基因組
第1章 基因組、轉錄組和蛋白質組
1.1 DNA
1.2 RNA和轉錄組
1.3 蛋白質和蛋白質組
總結
第2章 研究DNA
2.1 用于DNA操作的酶
2.2 DNA克隆
2.3 聚合酶鏈反應（PCR）
總結
第3章 基因組作圖
3.1 遺傳圖譜和物理圖譜
3.2 遺傳作圖
3.3 物理作圖
總結
第4章 基因組測序
4.1 DNA測序方法學
4.2 連續DNA序列的組裝
4.3 人類基因組計劃
總結
第5章 解讀基因組序列
5.1 在基因組序列中定位基因
5.2 確定單個基因的功能
5.3 個例研究：標注釀酒酵母基因組序列
總結
第6章 理解基因組是如何行使功能的
6.1 轉錄組研究
6.2 蛋白質組研究
6.3 蛋白質組之外
總結
第2篇 基因組結構
第7章 真核生物核基因組
7.1 核基因組包含于染色體當中
7.2 真核生物核基因組的遺傳特征
總結
第8章 原核生物基因組和真核生物細胞器基因組
8.1 原核生物基因組的物理特征
8.2 原核生物基因組的遺傳學特征
8.3 真核生物細胞器基因組
總結
第9章 病毒基因組和可移動的遺傳元件
9.1 噬菌體和真核生物病毒的基因組
9.2 可移動的遺傳元件
總結
第3篇 基因組如何行使功能
第10章 接近基因組
10.1 細胞核內部
10.2 染色質修飾和基因組表達
10.3 DNA修飾和基因組表達
總結
第11章 轉錄起始復合物的組裝
11.1 DNA結合蛋白及其結合位點
11.2 轉錄起始中DNA—蛋白質的相互作用
11.3 轉錄起始的調控
總結
第12章 RNA的合成和加工
12.1 細菌RNA的合成和加工
12. 2真核細胞RNA的合成和加工
總結
第13章 蛋白質組的合成與加工
13.1 RNA在蛋白質合成中的作用
13.2 核糖體在蛋白質合成中的作用
13.3 蛋白質翻譯后加工
13.4 蛋白質降解
總結
第14章 基因組活性的調控
14.1 基因組活性的瞬時變化
14.2 基因組活性的永久性和半永久性變化
14.3 發育過程中基因組活性的調節
總結
第4篇 基因組如何復制及進化
第15章 基因組復制
15.1 拓撲學問題
15.2 復制過程
15.3 真核生物基因組復制的調控
總結
第16章 突變和DNA修復
16.1 突變
16.2 DNA修復
總結
第17章 重組
17.1 同源重組
17.2 位點特異性重組
17.3 轉座
總結
第18章 基因組如何進化
18.1 基因組：最初的100億年
18.2 新基因的獲得
18.3 非編碼DNA與基因組進化
18.4 人類基因組：最近的500萬年
總結
第19章 分子系統發生學
19.1 從分類學到分子系統發生學
19.2 基于DNA的系統發生樹的重建
19.3 分子系統發生學的應用
總結
附錄
詞匯表
索引
第三版前言
第二版前言
第一版前言
內容介紹
縮略語
第1篇 研究基因組
第1章 基因組、轉錄組和蛋白質組
1.1 DNA
1.2 RNA和轉錄組
1.3 蛋白質和蛋白質組
總結
第2章 研究DNA
2.1 用于DNA操作的酶
2.2 DNA克隆
2.3 聚合酶鏈反應（PCR）
總結
第3章 基因組作圖
3.1 遺傳圖譜和物理圖譜
3.2 遺傳作圖
3.3 物理作圖
總結
第4章 基因組測序
4.1 DNA測序方法學
4.2 連續DNA序列的組裝
4.3 人類基因組計劃
總結
第5章 解讀基因組序列
5.1 在基因組序列中定位基因
5.2 確定單個基因的功能
5.3 個例研究：標注釀酒酵母基因組序列
總結
第6章 理解基因組是如何行使功能的
6.1 轉錄組研究
6.2 蛋白質組研究
6.3 蛋白質組之外
總結
第2篇 基因組結構
第7章 真核生物核基因組
7.1 核基因組包含于染色體當中
7.2 真核生物核基因組的遺傳特征
總結
第8章 原核生物基因組和真核生物細胞器基因組
8.1 原核生物基因組的物理特征
8.2 原核生物基因組的遺傳學特征
8.3 真核生物細胞器基因組
總結
第9章 病毒基因組和可移動的遺傳元件
9.1 噬菌體和真核生物病毒的基因組
9.2 可移動的遺傳元件
總結
第3篇 基因組如何行使功能
第10章 接近基因組
10.1 細胞核內部
10.2 染色質修飾和基因組表達
10.3 DNA修飾和基因組表達
總結
第11章 轉錄起始復合物的組裝
11.1 DNA結合蛋白及其結合位點
11.2 轉錄起始中DNA—蛋白質的相互作用
11.3 轉錄起始的調控
總結
第12章 RNA的合成和加工
12.1 細菌RNA的合成和加工
12. 2真核細胞RNA的合成和加工
總結
第13章 蛋白質組的合成與加工
13.1 RNA在蛋白質合成中的作用
13.2 核糖體在蛋白質合成中的作用
13.3 蛋白質翻譯后加工
13.4 蛋白質降解
總結
第14章 基因組活性的調控
14.1 基因組活性的瞬時變化
14.2 基因組活性的永久性和半永久性變化
14.3 發育過程中基因組活性的調節
總結
第4篇 基因組如何復制及進化
第15章 基因組復制
15.1 拓撲學問題
15.2 復制過程
15.3 真核生物基因組復制的調控
總結
第16章 突變和DNA修復
16.1 突變
16.2 DNA修復
總結
第17章 重組
17.1 同源重組
17.2 位點特異性重組
17.3 轉座
總結
第18章 基因組如何進化
18.1 基因組：最初的100億年
18.2 新基因的獲得
18.3 非編碼DNA與基因組進化
18.4 人類基因組：最近的500萬年
總結
第19章 分子系統發生學
19.1 從分類學到分子系統發生學
19.2 基于DNA的系統發生樹的重建
19.3 分子系統發生學的應用
總結
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