《分子模擬》(第二版)第一篇為分子模擬原理，在介紹分子模擬的物理和化學原理，如統計力學、力場、能量最小化和量子化學等內容的基礎上，介紹了一些模擬基本方法，如Monte Carlo 模擬、分子動力學模擬、介觀模擬、定量結構性質關係等。第二篇為分子模擬實驗，以具體實例介紹了分子模型的創建與優化、分子性質的計算和分析、勢能面的構建、化學反應模擬、分子光譜計算、均相體系和多相體系的分子動力學模擬、固體材料表面吸附行為的Monte Carlo 模擬、粗粒化及介觀模擬、定量構效關係預測等內容。為了提高讀者的操作能力，本書附有一些計算實例和運行腳本，讀者可掃二維碼學習。附錄為Materials Studio、Gromacs 的簡明操作手冊，Orgin 自定義函數擬合及構建三維勢能面、能量折線圖的方法等內容,讀者掃描二維碼可查看。 《分子模擬》(第二版)可作為化學、化工、材料、生命科學、醫藥等專業高年級本科生和研究生的教材，也可供相關領域的科研工作者參考使用。
