商品簡介
《生命科學名著:微生物基因組》可供從事微生物學、基因組學、病理學、生態學、酶學、蛋白質組學、植物病理學等領域的研究生、教師和研究人員閱讀。
序
微生物基因組學是一個非常大的領域,當選擇每一章的題目時,我們意識到,要么涵蓋較大範圍而對相關知識僅作初步介紹,要么把我們認為非常重要的一些問題深入討論,我們選擇了前者。我們希望《微生物基因組》-書能描述更廣的內容,能使初涉這一領域的讀者和具有專業知識的人都對此書感興趣。作為主編,我們發現一些很有趣的事情,儘管題目各不相同,某些重複出現的主題卻貫穿全書,如基因水平轉移、比較基因組分析的重要性和基於微陣列的基因表達分析。
《微生物基因組》分為6個主要部分,為讓讀者更好地了解這一領域的發展,分出一部分介紹微生物基因組學歷史是十分必要的,所以主編委託Hamilton Smith準備這一介紹性文章。“作為基因組學工具的生物信息學”部分,提供了用於基因組學及其應用的最常用的計算工具。“核心功能”部分介紹了每個微生物基因組都包括的微生物代謝、運輸和細胞循環等過程。“微生物基因組的進化”中,安排了一系列章節,目的是告訴大家,基因組學如何重建微生物世界的歷史和動態性。在“微生物基因組的調查”中,組織了一系列章節並有選擇性地論述了一些生物類群。儘管沒有涵蓋每種微生物基因組(而另一些種在多個章節中被描述),但我們的目的是提供一些從基因組研究可以獲得的生物信息。最後是“基因組數據庫的應用”,這部分描述如何用基因組序列研究微生物中最重要的問題。值得一提的是,在本書撰寫期間,即2002年底到2003年初,許多尚未完成的基因組測序現已完成,感興趣的讀者可以訪問像基因組研究所數據庫這樣的網站,以便得到最新的信息。
如果沒有TrinaEacho女士的幫助,這本書不可能成功出版,她利用很多周末時間組織各個章節並形成初稿,主編們對她的諸多貢獻非常感激。
當然,此書難免有疏漏之處,而且它也不能涵蓋所有的重要方面,我們希望著者們的集思廣益及各章節的內容能給諸位讀者以啟發。微生物基因組學包括了進化與種群生物學、基因表達分析、蛋白質組學以及很多與DNA序列相關的研究。毫不誇張地說,微生物基因組學跨越了微生物學科本身的廣度和深度。
目次
譯者的話
序
前言
編著者
第一部分:引言
1微生物基因組學的歷史
第二部分:作為基因組學工具的生物信息學
2尋找基因和全基因組比較的工具
3 TIGR的細菌基因組註釋
4生物信息學與微生物致病作用
5噬菌體生物信息學
第三部分:核心功能
6微生物代謝比較
7膜轉運蛋白的基因組學分析
8用基因組學分析細菌細胞週期
第四部分:微生物基因組的進化
9原核生物的進化及分類簡史
10細菌基因組如何變化
11基因組學時代的細菌生物多樣性概念
12病原菌和共生菌與寄主的協同進化
第五部分:微生物基因組的調查
13植物病原菌基因組調查
14不產氧光合細菌
15嗜熱微生物基因組
16病原腸細菌基因組
17專性細胞內病原體
18低G+C含量革蘭氏陽性細菌基因組
19放線菌(G+,高G+C含量)基因組學
20寄生蟲基因組學
21極端嗜鹽古生菌基因組分析
第六部分:基因組數據庫的應用
22微陣列表達分析和細菌基因組
23微生物種群基因組學與生態學
24基因組學在生物催化和生物降解中的應用
25酶的發現與微生物基因組學
26基因組學在藥物發現過程中的整合
27基因組法開發疫苗
28微生物蛋白質組學
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