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化學圖文設計與分子模擬計算(簡體書)
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化學圖文設計與分子模擬計算(簡體書)

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商品簡介
目次

商品簡介

本書以著名的桌面化學辦公系統軟件ChemBioOffice2008和廣泛使用的量化計算軟件Gaussian03的使用為例,采用圖形界面與文字敘述相對照的方式,詳細介紹了化學圖文設計和分子模擬計算的方法。內容包括:計算機化學及化學模擬的概念與方法;ChemSketch化學圖文繪制技巧;ChemBioDraw化學生物繪圖工具的使用方法、結構查詢、結構與性質計算;ChemBio3D結構模型構建、修改、顯示與輸出的方法和技巧;ChemBio3D中量子化學接口軟件(MOPAC、Gaussian、Jaguar等)在分子模擬計算中的應用;Gaussian03輸入文件的編制、計算作業的運行、計算結果的觀察等方法;利用GaussView4.1創建、設置、運行與觀察Gaussian輸入/輸出文件的方法。書中采用眾多計算實例,介紹了單點能計算、幾何優化計算、頻率計算、高精度計算、化學反應路徑計算、激發態的計算和溶液中的模擬等計算方法和計算結果的查看。 本書可作為化學及相關專業高年級本科生、研究生的教材和化學專業教師及有關研究人員的參考書,也可作為相關軟件的使用參考書。

目次

第1章 計算機與化學
 1.1 計算機與化學
1.1.1 計算機化學
1.1.2 計算化學
1.1.3 理論化學
1.1.4 量子化學
 1.2 計算機化學的發展
 1.3 我國計算(機)化學的發展概況
 1.4 分子模擬與量化計算簡介
1.4.1 分子模擬的意義
1.4.2 分子模擬的一般過程
1.4.3 分子模型的構建
1.4.4 分子模擬的方法
1.5 常用化學軟件簡介
1.5.1 化學圖文設計軟件
1.5.2 計算化學與分子模擬軟件
1.5.3 化學數據庫
1.5.4 圖譜解析軟件
1.5.5 數據處理軟件
1.5.6 文獻管理軟件
1.6 計算化學應用
1.7 計算機化學的學習方法
1.8 相關網站及參考書
第2章 ChemSketch的使用
 2.1 ChemSketch概述
2.1.1 主要功能
2.1.2 軟件界面
2.2 結構模式
2.2.1 常用工具與快捷按鈕
2.2.2 基本操作
2.2.3 高級操作
2.2.4 二維優化
2.2.5 三維優化
2.2.6 模板的應用
2.2.7 模板的管理
 2.3 繪圖模式
2.3.1 常用工具與快捷按鈕
2.3.2 反應能量圖
2.3.3 原子軌道圖
2.3.4 實驗裝置圖
 2.4 分子性質的預測
第3章 ChemBioDraw的使用
 3.1 ChemBioDraw概述
3.1.1 版本介紹
3.1.2 運行系統要求
3.1.3 新特性
 3.2 ChemBioDraw工具欄與文檔
3.2.1 工具欄與窗口顯示
3.2.2 文檔操作
3.2.3 頁面設置
 3.3 ChemBioDraw操作實例
3.3.1 畫丙酮分子
3.3.2 使用環工具
3.3.3 畫反應式
3.3.4 畫中間體
3.3.5 使用碎片工具
3.3.6 畫多點配位結構
3.3.7 費歇爾投影式
3.3.8 畫透視圖
3.3.9 畫紐曼投影式
3.3.10 使用立體化學標記
3.3.11 使用模板
 3.4 結構式的基本畫法
……
第4章 ChemBio3D的使用
第5章 Gaussian的使用
第6章 GaussView的使用
附錄 能量單位

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