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《胡楊在鹽脅迫下差異表達基因的篩選以及胡楊PeSCL7基因功能分析》介紹了作物減產的原因。非生物脅迫因子(如高鹽、干旱、極端氣溫、澇害等)是造成世界范圍內作物減產,森林退化的主要因素。近年來通過對模式植物擬南芥(Arabidopsis
thaliana)的研究,發現植物通過多種途徑感應非生物逆境脅迫,并通過信號傳導,能量代謝等生理生化途徑來適應和抵抗逆境脅迫,在此生物過程中有大量的基因及其產物的參與。胡楊(Populus
euphratica
Oliv)系楊柳科楊屬中最古老、最原始的一個樹種,具有極強的耐旱,抗鹽性,在生態建設中具有極其重要的作用。通過對其抗逆機制的研究、優良性狀及其相關基因的發掘,采用常規育種與分子育種相結合的方法,將其優良抗性基因用于作物與林木的遺傳改良,從而培育出具有更強抗性的植物,以減少逆境所造成的損失以及改善不斷惡化的生態環境。
作者簡介
馬洪雙,男,1982年9月出生,山西省太原市人。2001年9月—2005年7月在山西農業大學生物技術專業學習,獲理學學士學位:2005年考入北京林業大學林學院攻讀森林培育碩士學位,2008年提前攻讀該專業博士學位并于2010年7月博士畢業。博士學位論文《胡楊在鹽脅迫下差異表達基因的篩選以及胡楊PeSCL7基因功能分析》獲得2011年北京市優秀博士學位論文。師從中國工程院院士、我國著名林學專家尹偉倫教授及夏新莉教授,從事森林培育及木本植物抗逆生理分子生物學的研究。參與國家自然科學基金項目(No.30571472.30730077)等多個國家級科研項目的研究,重點圍繞胡楊抗逆分子機制開展研究工作。目前,共發表4篇學術論文。
尹偉倫,中國工程院院士,樹木生物學教授,博士生導師。研究方向是樹木抗旱抗鹽機理,林木生長發育調控機制及分子育種,主持的課題有國家“九五”、“十五”科技攻關項目、國家“十一五”、 “十二五”科技支撐項目等國家級科研項目。先后獲得國家發明三等獎、國家科技進步二等獎、國家科技進步三等獎、國家級教學成果一等獎等榮譽。
夏新莉。北京林業大學植物學教授,博士生導師。從事植物抗逆生理與分子機制的研究。主持國家自然科學基金課題、國家“863”課題、國家“十一五”科技支撐課題等課題研究。發表論文40余篇,其中被SCl收錄21篇。入選2007年度教育部新世紀優秀人才計劃。曾獲國家科技進步二等獎1項,北京市科技進步二等獎1項,中國林學會“梁希獎”。
尹偉倫,中國工程院院士,樹木生物學教授,博士生導師。研究方向是樹木抗旱抗鹽機理,林木生長發育調控機制及分子育種,主持的課題有國家“九五”、“十五”科技攻關項目、國家“十一五”、 “十二五”科技支撐項目等國家級科研項目。先后獲得國家發明三等獎、國家科技進步二等獎、國家科技進步三等獎、國家級教學成果一等獎等榮譽。
夏新莉。北京林業大學植物學教授,博士生導師。從事植物抗逆生理與分子機制的研究。主持國家自然科學基金課題、國家“863”課題、國家“十一五”科技支撐課題等課題研究。發表論文40余篇,其中被SCl收錄21篇。入選2007年度教育部新世紀優秀人才計劃。曾獲國家科技進步二等獎1項,北京市科技進步二等獎1項,中國林學會“梁希獎”。
名人/編輯推薦
《胡楊在鹽脅迫下差異表達基因的篩選以及胡楊PeSCL7基因功能分析》由中國環境出版社出版。
目次
1 引言
1.1植物抗逆相關基因研究進展
1.2胡楊抗逆性研究現狀
1.3cDNA—AFLP技術應用現狀
1.4研究意義與必要性
1.5研究思路與技術路線
2 材料方法
2.1材料
2.2方法
3 胡楊cDNA-AFLP體系的建立
3.1材料與方法
3.2結果與分析
3.3討論
4 胡楊鹽脅迫誘導相關基因的表達與功能分析
4.1材料與方法
4.2結果與分析
4.3討論
4.4結論
5 毛果楊GRAS/SCL基因的電子克隆
5.1材料和方法
5.2結果與分析
6胡楊SCL7基因及其啟動子的克隆與分析
6.1材料與方法
6.2結果與分析
6.3討論
7 PeSCL7的表達特征分析及亞細胞定位分析
7.1材料與方法
7.2結果與分析
7.3 討論
8 T-DNA插入缺失突變體的鑒定
8.1材料與方法
8.2結果與分析
8.3 討論
9 在atscl7突變體和野生型擬南芥中超表達PeSCL7
的轉基因植株表型分析
9.1材料與方法
9.2結果與分析
9.3討論
10 結論與展望
10.1結論
10.2正在進行的工作
10.3研究前景
參考文獻
附錄1縮略詞表
附錄2本研究所克隆胡楊序列
致謝
1.1植物抗逆相關基因研究進展
1.2胡楊抗逆性研究現狀
1.3cDNA—AFLP技術應用現狀
1.4研究意義與必要性
1.5研究思路與技術路線
2 材料方法
2.1材料
2.2方法
3 胡楊cDNA-AFLP體系的建立
3.1材料與方法
3.2結果與分析
3.3討論
4 胡楊鹽脅迫誘導相關基因的表達與功能分析
4.1材料與方法
4.2結果與分析
4.3討論
4.4結論
5 毛果楊GRAS/SCL基因的電子克隆
5.1材料和方法
5.2結果與分析
6胡楊SCL7基因及其啟動子的克隆與分析
6.1材料與方法
6.2結果與分析
6.3討論
7 PeSCL7的表達特征分析及亞細胞定位分析
7.1材料與方法
7.2結果與分析
7.3 討論
8 T-DNA插入缺失突變體的鑒定
8.1材料與方法
8.2結果與分析
8.3 討論
9 在atscl7突變體和野生型擬南芥中超表達PeSCL7
的轉基因植株表型分析
9.1材料與方法
9.2結果與分析
9.3討論
10 結論與展望
10.1結論
10.2正在進行的工作
10.3研究前景
參考文獻
附錄1縮略詞表
附錄2本研究所克隆胡楊序列
致謝
書摘/試閱
6 胡楊SCL7基因及其啟動子的克隆與分析
GRAS/SCL蛋白是植物中特有的蛋白家族,它的名稱來源于首批獲得的三個成員GIBBERELLIN ACID INSENSITIVE(GAI)、REPRESSOR of GA1(RGA)和SCARECROW(SCR),一股由400~770個氨基酸組成。它們在植物信號轉導、激素的調節以及分生組織的保持中起關鍵性作用。GAI和RGL在GA(赤霉素)的信號轉導中有著重要作用(Silverstone等,1998),通過對突變體研究發現SCARECROW(SCR)與根的發育有關(Benfey等,1993),由于GAI、RGA、SCR和SCARECLOW-like(SCL)蚩自在C末端有著一些相同的保守結構域,而N端都具有可變區,因此被統一為GRAS/SCL家族。盡管沒有找到直接的DNA結合序列,GRAS家族蛋白仍被歸為轉錄因子家族(Riechmann等,2000;ZenteUa等,2007)。
GRAS蛋白目前在擬南芥中已分離出33種,水稻中52種,玉米中50種(Lim等,2005)。它們在植物信號轉導、激素的調節以及分生組織的保持中起關鍵性作用。對擬南芥GRAS家族蛋白進行進化樹分析后將其分為8個分支,PAT1分支被發現在光敏色素A和B信號傳導過程中具有作用(Bolle等,2000;Torres—Galea等,2006)。SCL9分支中的SCL14是一種TGA互作蛋白,含有TGA的啟動子受到SA-(水楊酸)和2,4-D-(生長素類似物)誘導后,SCL14可以調控其靶基因參與外源性化學物質和內源性可能的有害代謝產物的解毒(Fode等,2008)。在SHR分支中,SHR通過輻式信號通路調控根的輻式生長(Helariutta等,2000)。DELLA分支是在GRAS家族中具有重要功能的一類蛋白,這類蛋白在GA的信號通路里作為負調控因子調節植物生長(Silverstone等,1998)。SCR分支是一類與根的生長發育有關的蛋白(Benfey等,1993)。LS分支還未見相關研究報道。SCL4/7分支也未見相關報道,但在本試驗中,從胡楊中克隆出一個GRAS/SCL家族成員屬于這個分支,通過本實驗,證明其表達受到逆境的誘導,通過轉基因擬南芥發現其可以提高轉基因植株的抗逆性。HAM分支中的SCL6,SCL22和SCL27在先前的報道中發現是miRNA171的靶基因(Llave等,2002),其具體功能還需進一步研究。
郭華軍等(2009)利用功能基因組學手段,通過對擬南芥ATH1基因芯片數據進行生物信息學挖掘,發現了將近10個GRAS家族基因與滲透和干旱脅迫有關,其中SCL5、SCL7、SCL11、SCL13、SCL14、SCL15和SCL26最為顯著。然后進一步利用功能基因組平臺,以SCL13為例,發現SCL13基因在應答滲透和干旱脅迫時可能參與了依賴于ABA的信號轉導途徑。
本研究以GRAS/SCL轉錄因子為研究對象,在楊樹基因組數據庫分析的基礎上,通過RT-PCR的方法從鹽處理的胡楊葉片中克隆得到胡楊SCL7基因,并進行序列測定。
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