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《中醫藥信息學原理》主要從中醫藥信息學的研究對象——人體穩態信息的信息流程著手，論述了穩態信息的形成和屬性，穩態信息的獲取和處理，以及中醫藥信息流程中執行的兩大準則。第一章主要闡述了穩態信息的形成，即人體的結構、功能及其相互間的關聯關係，在自組織功能下協同達到同步，從而形成人體穩態信息的過程。第二章論述了穩態信息的屬性，即穩態信息具有認識論屬性、現象屬性、整體屬性和時間屬性。第三章討論了穩態信息的獲取過程，認為穩態是人體系統中各因素及因素間關聯關係的同步，穩態信息的獲取過程就是由個體在一定的尺度和維度上認知人體因素及其關聯關係，在一定規模上獲得穩態信息。第四章主要討論了穩態信息的處理，綜合了發散性思維和指向性思維，組成他組織，刺激人體自組織級聯反應，從而使人體穩態趨向更佳。第五章總結了中醫藥信息流程中執行的兩大準則——相似性準則和不確定性準則，這兩個準則使得中醫藥信息處理能夠貼近真實。
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