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生物分子網路的構建和分析(簡體書)
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目次

商品簡介

進入後基因時代後,進入了在系統層面上研究生命現象的新許段。系統層面上的研究從本質上涉及到生命現象在各個層次上的網絡研究,其中最重要一種是分子生物網絡。分子生物網絡的研究進一步促進了生物與數學、力學、物理和計算機的交叉研究。本書簡要地描述了產生這種研究的生物背景,全面地給出了分子生物網絡研究所需要的各種數理基礎知識。從交叉觀點,尤其是動力學和控制的觀點,系統地總結了分子生物網絡建模、動力學分析和控制方面所取得成果。本書適合於力學、數學、物理學、動力學、生命科學等相關專業的大學高年級學生以及研究生,以及從事與生命科學交叉研究的非生物專業的研究和技術人員。

名人/編輯推薦

劉曾榮和王瑞琦等編著的《生物分子網絡的構建和分析》內容介紹:20世紀70年代,人們在研究兩個客體相互作用時發現了混沌動力學行為,從而推動了非線性科學迅速發展,在此基礎上,人們又進一步考慮許多客體發生相互作用時會發生什麼現象的問題模型研究表明這種系統存在著不同於定態、週期態和混沌態的更複雜的動力學行為,於是人們對這種現象產生了興趣,提出了複雜性問題,在20多年對複雜性問題的研究中,科學家碰到了前所未有的困難,當然也總結了不少經驗,這些經驗中最重要的一條是複雜性的研究首先要基於複雜系統分析,從具體的複雜系統研究中找出規律性東西,進一步的工作又認識到生命系統是複雜系統最典型的例子這樣就自然地從複雜性理論角度提出了研究生物問題的要求。

目次

《非線性動力學叢書》序
前言
緒論
0.1 分子生物學簡介
0.2 分子系統生物學研究的基本特徵
參考文獻
第1章 複雜網絡
1.1 複雜系統研究的概況
1.2 生物系統是複雜系統
1.3 網絡基礎理論
1.4 複雜系統建模——複雜網絡
1.5 生物網絡特徵的簡介
參考文獻
第2章 化學反應動力學
2.1 質量作用定律
2.2 酶動力學
參考文獻
第3章 單調動力系統
3.1 單調動力系統基礎
3.2 單調動力系統的動態與分解
參考文獻
第4章 基於生物數據的網絡推導
4.1 概述
4.2 轉錄調控網絡
4.3 轉錄後調控網絡
4.4 轉錄調控網絡模體
4.5 常用生物網絡分析和可視化軟件
4.6 小結
參考文獻
第5章 由進化論構建網絡的方法
5.1 用DD方法研究生物網絡的度負關聯性
5.2 DD方法構建具有綜合生物網絡特徵的模型
5.3 用DD方法構建平均場意義下的生物網絡
參考文獻
第6章 基於生物分子網絡的知識發現
6.1 網絡模體
6.2 生物網絡中的分層結構
6.3 基於生物網絡的知識挖掘
參考文獻
第7章 細胞信號轉導通路:建模和識別
7.1細胞信號轉導
7.2 信號轉導網絡建模
7.3 基於蛋白質相互作用網絡的信號通路識別
7.4 信號途徑的應用
7.5 總結
參考文獻
第8章 具有典型動力學性質的生物分子網絡介紹
8.1具有平凡動力學特徵的網絡
8.2 具有開關效應的網絡
8.3 具有振盪效應的網絡
8.4 具有可激發性質的網絡
參考文獻
第9章 生物分子網絡中的調控現象
9.1 基因表達調控
9.2 小RNA調控
9.3 積分控制
9.4 單調控制系統
參考文獻
第10章 一些生命現象的網絡分析例子
10.1 細胞週期
10.2 酵母細胞週期網絡的離散和連續模型
10.3 酵母細胞週期網絡的隨機模型
10.4 生物節律
10.5 哺乳動物節律的網絡模型
10.6 細胞通信和細胞同步行為研究
10.7 適應性模型
參考文獻

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