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本書內容主要為理論教學部分。理論教學部分有序言、總論和各論，是本教材的重點內容。第一篇為總論部分，較系統地介紹了畜牧微生物學的理論和實驗技術，主要包括微生物的形態、結構、生理生化、分類、生態、命名、與外界環境條件相互作用、遺傳變異和動物免疫學等基本理論和基本知識。第二篇為各論部分，介紹了各種重要動物病原微生物的主要特性、飼料微生物以及動物性食品衛生相關微生物的有利與有害作用。本書既注重理論教學，又注重實際操作，並將近年來一些新內容做了適當介紹。
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