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動物育種中的統計計算(第二版)(簡體書)
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商品簡介
目次

商品簡介

自《動物育種中的統計計算:Julia語言應用》第一版於2016年出版以來,得到業界同行的一致肯定。五年來動物育種領域又有了許多新的進展.Julia語言也已經由0.4版發展到現在的1.6版。國內也有了Julia語言的專門討論社區,Julia語言的語法發生了許多變化,已有的許多代碼不能夠順利運行。
《動物育種中的統計計算(第二版)》是第二版,將原有代碼用Julia 1.6進行了改寫,並補充許多新的內容和代碼,主要有Julia語言新的語法、基因組分析代碼實例、稀有變異模擬及分析代碼、非加性效應模擬及分析代碼、Julia語言和R語言混合編程等內容。應許多讀者要求,提供全書大部分章節的源代碼。但是,由於撰寫時間有限,沒有涉及機器學習(深度學習)及並行計算方面的內容,在這兩個領域快速發展的時代,確實是一種遺憾,有待在下一版本或其他論著中進一步完善。
《動物育種中的統計計算(第二版)》的出版發行獲得國家自然科學基金項目(31760660)、內蒙古自治區自然科學基金項目(2019MS03092)、內蒙古自治區肉羊遺傳評估方法與應用工程技術研究中心、河套學院引進人才科研啟動項目(HYRC2014003)、內蒙古自治區高等學校“青年科技英才支持計劃”(NJYT-17-A21)、巴彥淖爾市科技創新基金項目、巴彥淖爾市科技計劃項目(BK22016)、河套學院“教師教”和“學生學”專項研究項目(HTXYJXY18018)、內蒙古自治區科技計劃項目(2020GG0201)、巴彥淖爾市科協飛翔計劃、內蒙古自治區科技廳項目巴彥淖爾市肉羊遺傳評估雲平台構建(2020GG0201)、河套學院畜牧業大數據研究中心、巴彥淖爾市肉羊育種能力建設博士科研工作站等項目支持。

自《動物育種中的統計計算:Julia語言應用》第一版於2016年出版以來,得到業界同行的一致肯定。五年來動物育種領域又有了許多新的進展.Julia語言也已經由0.4版發展到現在的1.6版。國內也有了Julia語言的專門討論社區,Julia語言的語法發生了許多變化,已有的許多代碼不能夠順利運行。本書是第二版,將原有代碼用Julia 1.6進行了改寫,並補充許多新的內容和代碼,主要有Julia語言新的語法、基因組分析代碼實例、稀有變異模擬及分析代碼、非加性效應模擬及分析代碼、Julia語言和R語言混合編程等內容。應許多讀者要求,提供全書大部分章節的源代碼。但是,由於撰寫時間有限,沒有涉及機器學習(深度學習)及並行計算方面的內容,在這兩個領域快速發展的時代,確實是一種遺憾,有待在下一版本或其他論著中進一步完善。
本書的出版發行獲得國家自然科學基金項目(31760660)、內蒙古自治區自然科學基金項目(2019MS03092)、內蒙古自治區肉羊遺傳評估方法與應用工程技術研究中心、河套學院引進人才科研啟動項目(HYRC2014003)、內蒙古自治區高等學校“青年科技英才支持計劃”(NJYT-17-A21)、巴彥淖爾市科技創新基金項目、巴彥淖爾市科技計劃項目(BK22016)、河套學院“教師教”和“學生學”專項研究項目(HTXYJXY18018)、內蒙古自治區科技計劃項目(2020GG0201)、巴彥淖爾市科協飛翔計劃、內蒙古自治區科技廳項目巴彥淖爾市肉羊遺傳評估雲平台構建(2020GG0201)、河套學院畜牧業大數據研究中心、巴彥淖爾市肉羊育種能力建設博士科研工作站等項目支持。
希望本書的再次修訂出版,能推進Julia語言在中國動物育種領域的發展,衷心希望本書能成為一本對廣大動物育種工作者有價值的參考書。由於作者水平有限,書中難免有許多疏漏和不足,希望廣大讀者不吝賜教。

目次

章 Julia 語言使用說明

第二章系譜數據處理方法 .

節、近交系數與親緣系數 .

第二節分子血緣相關矩陣及其逆矩陣計算....

第三節、計算實例

?

第三章動物遺傳育種中的數據模擬 .........

節隨機數和隨機變量的產生

第二節誤差計算...

第三節使用 Julia 語言模擬數據..

第四節計算實例 ...

第五節基因組模擬軟件 XSim,

第四章,線性模型的建立和求解,

節,單因子模型 .....

第二節二因子模型 .........

第三節建立 Henderson 混合模型方程組 .

.第四節稀疏矩陣使用 ....

?

第五章線性模型的擴展

節有重復記錄的動物模型.....

第二節母體效應模型,

?

第六章多性狀模型優勢

節多性狀模型 ...

第二節Julia 語言實現 MT 模型

第三節帶有缺失數據的多性狀模型

第七章分子標記和多基因效應單性狀模型

節標記輔助選擇..

第二節混合模型方程組的儲存技術

第三節Julia 語言示例 .....

第八章MCMC 算法

節貝葉斯統計....

第二節Julia 語言的實現....

第三節貝葉斯統計在多元線性模型中的應用

第四節貝葉斯統計示例.....

第五節多性狀模型的 Gibbs 抽樣,

第六節思考題解答 ......

第九章全基因組連鎖及關聯分析

節考慮稀有變異非加性效應的基因組分析

第二節多元混合線性模型...

第三節貝葉斯 GWAS

第四節單步全基因組分析方法

第五節 GBLUP 的準確性

第六節 Julia 語言示例.

第十章附錄 ..

1節線性模型簡介 .

第二節基於系譜的混合線性模型

第三節預測 SNP 效應的固定效應模型.

第四節結合有基因型和無基因型家畜數據

第五節貝葉斯 GWAS ..

第六節統計基因組學基礎

第七節J Julia 和 R 語言混合編程解決稀有變異關聯研究問題

 

參考文獻

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