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《基因論》是摩爾根染色體遺傳理論的代表之作，本書的出版標誌了“基因學說”的創立。作者提出基因是組成染色體的遺傳單位，是一個有機的化學實體。它能控制遺傳性狀的發育，也是突變、重組、交換的基本單位。《基因論》內容包括了遺傳學的基本原理、遺傳的機制、突變的起源、染色體畸變、基因和染色體在性別決定方面的作用等。本書總結了作者及其團隊以果蠅為主要實驗材料的遺傳研究成果，其理論是遺傳學發展史上的一次重大飛躍。
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