商品簡介
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蛋白質相互作用是后基因組時代生命科學最重要的研究領域之一。本書論述了蛋白質相互作用的研究方法和技術,在內容編排方面體現了下列特色: 內容系統,涵蓋蛋白質相互作用的結構基礎、體外檢測蛋白質相互作用的生物化學和生物物理學方法、異種細胞體系內研究蛋白質相互作用的常用方法、在活細胞中監測蛋白質相互作用的方法以及計算機分析方法五大部分; 收錄了幾十個蛋白質相互作用的實驗方案,每個方案針對具體研究體系展開,附有詳細的“注意事項”,具有較強的實用性和可操作性。 本書是一本實用性很強的實驗手冊,可供分子生物學、細胞生物學、遺傳學、醫學基礎等領域的研究生、高年級本科生和其他研究人員閱讀參考。
目次
第一章 蛋白質蛋白質相互作用的結構基礎
第一節 蛋白質蛋白質相互作用的特點
一、蛋白質作用界面的大小
二、蛋白質作用界面的形狀
三、蛋白質作用界面的互補性
四、蛋白質作用界面的疏水性及氫鍵
五、蛋白質復合物的結合力
六、蛋白質復合物結合作用界面殘基的傾向性
七、蛋白質區段及二級結構
八、蛋白質復合物在形成時的構象變化
第二節 結構域結構域相互作用
一、蛋白質結構域
二、蛋白質結構域結構域相互作用的普遍規律
第三節 蛋白質蛋白質相互作用與信號轉導
參考文獻
第二章 化學交聯技術及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗操作
一、材料
二、實驗方法
參考文獻
第三章 免疫共沉淀技術及實驗方案
第一節 實驗原理
一、免疫共沉淀
二、蛋白質印跡檢測
第二節 實驗方案
一、材料
二、方法
第三節 小結
第四節 免疫共沉淀的優缺點及展望
參考文獻
第四章 融合蛋白親和色譜法及實驗方案
第一節 實驗原理
一、親和色譜
二、融合蛋白親和色譜
第二節 實驗操作
一、材料
二、方法
參考文獻
第五章 噬菌體展示技術及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗方案
一、材料
二、方法
參考文獻
第六章 細菌雙雜交技術及實驗方案
第一節 實驗原理
一、利用轉錄抑制因子構建的細菌雙雜交系統
二、依賴于信號通路重建的細菌雙雜交系統
三、通過募集RNA聚合酶而實現轉錄激活的細菌雙雜交系統
第二節 實驗操作
一、材料
二、方法
參考文獻
第七章 酵母雙雜交技術及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗方案
一、實驗材料
二、實驗方法
三、注意事項
四、酵母雙雜交過程中常遇到的一些問題及相應的解決方案
參考文獻
第八章 哺乳動物雙雜交技術及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗方案
一、檢測兩個目的蛋白質之間的相互作用
二、高通量檢測蛋白質與蛋白質之間的相互作用
參考文獻
第九章 雙向電泳技術及實驗方案
第一節 實驗原理
一、等電聚焦
二、SDS—PAGE
第二節 實驗方案
一、材料
二、方法
參考文獻
第十章 BN—PAGE技術及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗方案
一、材料
二、方法
參考文獻
第十一章 Far Western技術及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗操作
一、方案Ⅰ:蛋白混合物的Far Western blot分析(放射自顯影法)
二、方案Ⅱ:利用Far western blot來識別相互作用的蛋白(抗體孵育法)
三、方案Ⅲ:在Far western blot中用肽鑒別特異的相互作用序列
參考文獻
第十二章 熒光凝膠阻滯及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗方案
一、材料
二、方法
參考文獻
第十三章 熒光共振能量轉移技術及實驗方案
第一節 FRET的理論基礎
一、FRET的發生原理
二、FRET實驗方法
三、FRET探針
四、FRET的測試方法
第二節 實驗方案
一、材料
二、方法
參考文獻
第十四章 核磁共振技術及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗操作
一、材料
二、方法
參考文獻
第十五章 圓二色光譜技術及實驗方案
第一節 實驗原理
一、圓二色性及儀器測量原理
二、蛋白質CD產生原理
三、蛋白質CD測定及數據分析
第二節 實驗操作
一、蛋白結構變化分析
二、等溫滴加法測定蛋白質-蛋白質結合平衡常數
參考文獻
第十六章 計算機預測蛋白質-蛋白質相互作用
第一節 實驗原理
第二節 實驗操作
一、對公共數據庫中的蛋白質進行模序搜索
二、用戶輸入蛋白質序列進行模序搜索
三、使用Scansite模序檢索數據庫
四、使用自定義模序檢索數據庫
五、使用快速矩陣方法檢索數據庫
參考文獻
第十七章 利用互聯網資源來研究蛋白質-蛋白質相互作用
一、蛋白質序列信息
二、數據庫查詢
三、結構域檢索及相互作用預測
四、實驗過程中用到的網絡資源
五、綜合性網絡資源
參考文獻
第一節 蛋白質蛋白質相互作用的特點
一、蛋白質作用界面的大小
二、蛋白質作用界面的形狀
三、蛋白質作用界面的互補性
四、蛋白質作用界面的疏水性及氫鍵
五、蛋白質復合物的結合力
六、蛋白質復合物結合作用界面殘基的傾向性
七、蛋白質區段及二級結構
八、蛋白質復合物在形成時的構象變化
第二節 結構域結構域相互作用
一、蛋白質結構域
二、蛋白質結構域結構域相互作用的普遍規律
第三節 蛋白質蛋白質相互作用與信號轉導
參考文獻
第二章 化學交聯技術及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗操作
一、材料
二、實驗方法
參考文獻
第三章 免疫共沉淀技術及實驗方案
第一節 實驗原理
一、免疫共沉淀
二、蛋白質印跡檢測
第二節 實驗方案
一、材料
二、方法
第三節 小結
第四節 免疫共沉淀的優缺點及展望
參考文獻
第四章 融合蛋白親和色譜法及實驗方案
第一節 實驗原理
一、親和色譜
二、融合蛋白親和色譜
第二節 實驗操作
一、材料
二、方法
參考文獻
第五章 噬菌體展示技術及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗方案
一、材料
二、方法
參考文獻
第六章 細菌雙雜交技術及實驗方案
第一節 實驗原理
一、利用轉錄抑制因子構建的細菌雙雜交系統
二、依賴于信號通路重建的細菌雙雜交系統
三、通過募集RNA聚合酶而實現轉錄激活的細菌雙雜交系統
第二節 實驗操作
一、材料
二、方法
參考文獻
第七章 酵母雙雜交技術及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗方案
一、實驗材料
二、實驗方法
三、注意事項
四、酵母雙雜交過程中常遇到的一些問題及相應的解決方案
參考文獻
第八章 哺乳動物雙雜交技術及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗方案
一、檢測兩個目的蛋白質之間的相互作用
二、高通量檢測蛋白質與蛋白質之間的相互作用
參考文獻
第九章 雙向電泳技術及實驗方案
第一節 實驗原理
一、等電聚焦
二、SDS—PAGE
第二節 實驗方案
一、材料
二、方法
參考文獻
第十章 BN—PAGE技術及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗方案
一、材料
二、方法
參考文獻
第十一章 Far Western技術及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗操作
一、方案Ⅰ:蛋白混合物的Far Western blot分析(放射自顯影法)
二、方案Ⅱ:利用Far western blot來識別相互作用的蛋白(抗體孵育法)
三、方案Ⅲ:在Far western blot中用肽鑒別特異的相互作用序列
參考文獻
第十二章 熒光凝膠阻滯及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗方案
一、材料
二、方法
參考文獻
第十三章 熒光共振能量轉移技術及實驗方案
第一節 FRET的理論基礎
一、FRET的發生原理
二、FRET實驗方法
三、FRET探針
四、FRET的測試方法
第二節 實驗方案
一、材料
二、方法
參考文獻
第十四章 核磁共振技術及實驗方案
第一節 實驗原理
第二節 實驗操作
一、材料
二、方法
參考文獻
第十五章 圓二色光譜技術及實驗方案
第一節 實驗原理
一、圓二色性及儀器測量原理
二、蛋白質CD產生原理
三、蛋白質CD測定及數據分析
第二節 實驗操作
一、蛋白結構變化分析
二、等溫滴加法測定蛋白質-蛋白質結合平衡常數
參考文獻
第十六章 計算機預測蛋白質-蛋白質相互作用
第一節 實驗原理
第二節 實驗操作
一、對公共數據庫中的蛋白質進行模序搜索
二、用戶輸入蛋白質序列進行模序搜索
三、使用Scansite模序檢索數據庫
四、使用自定義模序檢索數據庫
五、使用快速矩陣方法檢索數據庫
參考文獻
第十七章 利用互聯網資源來研究蛋白質-蛋白質相互作用
一、蛋白質序列信息
二、數據庫查詢
三、結構域檢索及相互作用預測
四、實驗過程中用到的網絡資源
五、綜合性網絡資源
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