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《生物化學實驗指導書》共分為五大部分。第一部分生物化學實驗技術與方法，簡單講述基礎實驗操作過程中常用的、基本的實驗技術，如離心、鹽析、分光光度、層析分離、電泳，並結合第二部分內容，將基礎實驗部分涉及的實驗技術方法做了重點的介紹。第二部分基礎生物化學實驗，列舉了包括糖、蛋白質、酶、核酸等經典驗證性實驗。第三部分應用實驗，側重綜合運用知識能力的培養，列舉一些關於食品方向的實驗研究題目，旨在教師的指導下，鍛煉學生能夠根據研究題目的目的與要求，依據自己已有的知識，閱讀查閱資料，嘗試設計實驗方案、分析實驗結果，進一步提升自己的綜合應用能力。第四部分個案分析，針對第二部分基礎實驗中某些實驗出現的失敗現象，分析常見問題以及可能造成失敗的原因，為學生提供參考，以期學生能夠通過實踐真正自主提高自己的實驗水準，這也是《生物化學實驗指導書》的特色和亮點之一。第五部分附錄，提供基礎實驗涉及的基礎儀器設備操作使用、實驗室安全、常用試劑配製等工具性知識。
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